Nature Methods:通過納米孔技術,對所有20種蛋白質氨基酸及其修飾進行明確區分。

2023年9月25日,來自南京大學Shuo Huang小組在《自然-方法學》發表了標題為“Unambiguous discrimination of all 20 proteinogenic amino acids and their modifications by nanopore.”的研究成果,研究利用納米孔無偏倚區分了20種蛋白質氨基酸及其修飾。

 

 

據悉,天然蛋白質由20種蛋白質氨基酸及其翻譯后修飾組成。然而,由于缺乏合適的納米孔傳感器可以同時區分所有20種氨基酸及其PTM,因此尚未實現利用納米孔對蛋白質進行直接測序。

 

研究人員建立一種工程異質八聚體包皮分枝桿菌porin A(MspA)納米孔,其中包含唯一的Ni2+修飾。它可以完全區分所有20種蛋白氨基酸和4種代表性修飾氨基酸,Nω、N'ω-二甲基精氨酸(Me-R)、O-乙酰蘇氨酸(Ac-T)、N4-(β-N-乙?;?葡萄糖胺基)-天冬酰胺(GlcNAc-N)和O-磷絲質堿(P-S)。在機器學習的幫助下,其準確率達到了98.6%。

 

研究人員還使用該工具分析了氨基酸補充片劑和肽酶消化的氨基酸。這種同時區分所有20種蛋白氨基酸及其翻譯后修飾(PTM)的能力,表明該納米孔測序方法在蛋白質測序中的巨大應用潛能。

 

文章來源:

Wang, Kefan, Zhang et al,? Unambiguous discrimination of all 20 proteinogenic amino acids and their modifications by nanopore.DOI: 10.1038/s41592-023-02021-8 Nature Methods:最新IF:47.99

 

艾美捷科技優勢代理品牌

發表評論

:?: :razz: :sad: :evil: :!: :smile: :oops: :grin: :eek: :shock: :???: :cool: :lol: :mad: :twisted: :roll: :wink: :idea: :arrow: :neutral: :cry: :mrgreen: