科研熱點:RNA甲基化研究必看高分文章

最新科研熱點是什么?lncRNA、circRNA、腸道微生物、耐藥基因CRISPR文庫篩選、RNA甲基化、細胞焦亡、單細胞測序、高通量蛋白質組學等等都是如今研究得重點,但是今天要重點介紹得熱點是RNA甲基化,簡稱m6A。

 

為什么要介紹呢,因為一個月(5~6.10)就有數十篇高分文章online,涉及到植物、微生物、腫瘤、神經發育、干細胞等多個方向。

 

1.?RNA N6-methyladenosine methyltransferase-like 3 promotes liver cancerprogression through YTHDF2-dependent posttranscriptional silencing of SOCS2.Hepatology. 2018 Jun

 

2.?SUMOylation of the m6A-RNA methyltransferase METTL3 modulates its function.?Nucleic Acids Res. 2018 Jun 1

 

3.?RNA m6A methylation participates in regulation of postnatal development?of the mouse cerebellum. Genome Biol.?2018 May 31

 

4.?Ythdf2-mediated m6A mRNA clearance modulates neural development?in mice.?Genome Biol.?2018 May 31

 

5.?Dynamic transcriptomic m6A decoration: writers, erasers, readers and functions in RNA metabolism. Cell Res. 2018 May 22(綜述)

 

6.?Base modifications affecting RNA polymerase and reverse transcriptase fidelity.?Nucleic Acids Res. 2018 May 10

 

7.?N6-Methyladenosine modification of lincRNA 1281?is critically required formESC?differentiation potential.?Nucleic Acids Res. 2018 May

.......

 

m6a-rna

 

m6A是一種動態可逆的修飾方式,在轉錄后調控中發揮作用,其在調控基因表達、剪接、RNA 編輯、RNA 穩定性、控制mRNA壽命和降解、介導環狀RNA翻譯等方面扮演重要角色。

 

國家自然科學基金是每一位科研工作者必選的目標,2018年國自然基金結果出來后,從隨意統計的15項醫學部基金結果:

 

 

從圖中可以看出,面上項目九個,青年項目六個。腫瘤研究方向居多,占了12項??梢奟NA甲基化這個熱點已經在腫瘤這個領域悄悄興起,童鞋們追熱點課題,熱不熱,看腫瘤領域的情況就知道了。

 

2018國自然項目

生物鐘基因BMAL1在人類胚胎干細胞分化中的作用及其mRNA甲基化的調控
piRNA調節m6A RNA甲基化參與MM發生發展的機制研究
RNA甲基化酶METTL14介導的lncRNA-m6A修飾在肝癌干細胞中的作用及機制研究
CDCP1?m6A RNA甲基化調控在膀胱癌發生發展中的作用及其機制
RNA甲基化m6A修飾位點變異與先天性心臟病遺傳易感機制研究
m6A甲基化作用下的circHOOK3/miR558/ TGFβR1調控軸影響神經母細胞瘤發生、發展的作用機制
N6-Methyladenosine (m6A) 表觀遺傳修飾酶METTL3對食管癌的調控及機理研究
m6A甲基轉移酶METTL3促進結直腸癌增殖轉移的分子機制研究
香煙凝集物通過RNA-m6a甲基化修飾調控miRNA-25成熟在胰腺癌致病機制中的作用
TARBP2和m6A依賴的外泌體miRNAs篩選、鑒定及作為肝癌轉移標志物的評價

 

國自然所有的RNA甲基化的項目,也就10項左右,m6A研究方向有干細胞分化、piRNA、lncRNA、易感基因、circRNA、腫瘤、miRNA的甲基化、外泌體miRNA等,可謂都是非常吸引人的項目,滿打滿算,現在收集一些樣本或者細胞做一點MeRIP-seq,得到一些有意思的結果,相信這樣的創新點一定會加分不少。

 

如果想選RNA甲基化作為方向設計課題,可以從哪些方面著手?

 

總體來看,以RNA甲基化修飾為主題的基金申請還是一個藍海,?因此如果想選RNA甲基化修飾作為研究方向設計課題,可以從以下四種思路著手:

 

1. 研究RNA甲基化修飾過程中的參與者(Writer、Eraser和Reader)分子在疾病或者某一生命過程中的功能。比如:Mettl3介導m6A甲基化修飾調控慢性炎性疼痛機制研究。

 

2. 通過MeRIP–Seq/miCLIP等方法首先揭示疾病或者某一生命過程中RNA甲基化修飾的變化,即揭示疾病特異性m6ARNA甲基化圖譜。

 

3. 揭示疾病或者某一生命過程中某一基因的特定RNA甲基化修飾與疾病的關系。即:RNA甲基化修飾——基因轉錄后調控(比如選擇性剪接或者翻譯,再或者microRNA的產生過程)——基因表達異?!膊』蛘吣骋簧^程。

 

4. 鑒定參與RNA甲基化修飾的新分子,或者建立研究RNA甲基化修飾的新方法。

 

以上四種思路的研究難度是逐漸增加的,大家如果想選RNA甲基化修飾來作為研究方向,可以考慮逐漸增加難度,其中4建立新方法或者鑒定新分子可以說是科學家的工作了。

 

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