Image J新技能：生物膜圖像分析

生物膜也稱為生物被膜，是指附著于有生命或無生命物體表面被細菌胞外大分子包裹的有組織的細菌群體。生物膜細菌對抗生素和宿主免疫防御機制的抗性很強。生物膜中存在各種主要的生物大分子如蛋白質、多糖、DNA、RNA、肽聚糖、脂和磷脂等物質。生物膜的形成是一個動態的過程，包括細菌定殖階段、集聚階段、生物膜的成熟階段和細菌的脫落與再定植階段等四個階段（如下圖）。當浮游細菌與惰性物體表面或活性實體的表面接觸后，浮游細菌會粘附到物體表面，啟動在物體表面形成生物膜。

在研究原位生物膜的工具中，共聚焦顯微鏡（Confocal laser scanning microscopy,CLSM）是一種非常方便且好用的分析方法，如下列舉的文章中，作者結合CLSM技術和圖像處理軟件，實現了對生物膜的展示和定量分析。

那么如何進一步分析得到這樣的結果呢？

下面看運用Image J中的Comstat插件完成生物膜的分析

1、首先進入http://www.comstat.dk/界面

2、根據提示下載軟件包，解壓后點擊Image J圖標進入軟件主界面，然后點擊plugins-comstat2，調出分析窗口，在圖1窗口中點擊add按鈕添加數據，圖2中選擇需要分析的數據，圖3中勾選需要計算的參數，點擊go開始計算。

3、在圖4窗口中獲得分析數據。同時，軟件會將分析得到的數據以txt格式文件保存在源文件的文件夾中。這個軟件計算的參數非常多，篇幅有限，小編就不一一說明了，如果感興趣，可以參考comstat2軟件包中的 “COMSTAT 2.1 MANUAL”?pdf文檔，里面有非常詳細的說明。

圖4.數據展示窗口，也是運行狀態顯示窗口.

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