2023年10月20日，來自美國冷泉港實驗室Zachary B. Lippman等研究人員合作在學術期刊《科學》上發表了標題為“Idiosyncratic and dose-dependent epistasis drives variation in tomato fruit size. ”的研究成功，發現特殊和劑量依賴的上位性驅動番茄果實大小的變異。
據悉，基因間的上位性傳統上是通過消除蛋白質活性的突變來研究的，但大多數天然遺傳變異都是順式調控DNA，并定量影響基因的表達和功能。
研究人員利用植物干細胞回路中的天然和工程順式調節等位基因，系統地評估了控制番茄果實大小的上位性。結合一個啟動子等位基因系列和另外兩個基因位點，研究人員從46個基因型中收集了超過30000個表型數據點，從而量化等位基因強度如何改變上位性。研究人員發現了一種飽和劑量依賴關系，但也發現了等位基因特異性的相互作用，包括等位基因之間在馴化過程中驅動果實大小階躍變化的相互作用。
這篇文章研究了對番茄果實大小具有影響的上位性相互作用。通過分析基因組中的調控位點，可以更好地理解番茄果實大小的遺傳機制。這些方法和發現揭示了上位性中一個未被充分探索的層面，即基因調控網絡中順式調控等位基因的多樣性會引起非線性、不可預測的相互作用，從而塑造表型。
文章來源：
Lyndsey Aguirre, Anat Hendelman et al, Idiosyncratic and dose-dependent epistasis drives variation in tomato fruit size.DOI: 10.1126/science.adi5222，Science：最新IF：63.714
