正確使用基因和蛋白質的名稱格式對于科學研究的準確性和可理解性至關重要。采用大寫字母和斜體字的命名規則可以提高基因和蛋白質在科學界的識別和交流，同時也是對科學研究的尊重和規范要求。
一般規則
a. 在你的文稿中使用被普遍認可的基因/蛋白質名稱和符號(詳見下文)
b. 有時認可的基因/蛋白質名稱或符號已經不再有效。在這種情況下，第一次提及的基因/蛋白質需要先列出已被批準的名稱，然后在括號內注明其以前的名稱(曾被稱為XXX)。例如，“我們使用抗POU5F1蛋白的抗體(曾被稱為OCT-4)...”。請注意使用正確的符號，而不是以往的名稱。
不同物種有不同的規則
①、小鼠 / 大鼠 / 雞
A. 一般命名規則(適用于小鼠，大鼠和雞)：
· 基因的全名不用斜體，也不用希臘字母
例如：insulin-like growth factor 1(胰島素樣生長因子1)
· 基因符號不用希臘字母和連字符，使用斜體，第一個字母大寫，其余小寫
例如：Igf1?(斜體)(胰島素樣生長因子1)
· 蛋白質的名稱和基因符號相同，但不用斜體，并全部大寫
例如：IGF1
· mRNA和cDNA的基因符號和規定的格式
例如： "... levels of?Igf1?(italicized) mRNA increased when..."
· 首次提到的突變等位基因應該詳細列出
例如：Igf1tm1Arge/Igf1tm1Arge?(italicized) is one of several knockout alleles of?Igf1?(italicized)
· 所有字母和數字用斜體，等位基因的符號(tm1Arge)要用上標
· 經前面詳細描述之后，敲除的純合子可表示為Igf1-/-?(所有字母均用斜體，并且- / -用上標)；雜合子為Igf1 + / -?等。
B. 對于這些命名規定的詳細信息，請參閱：
· (小鼠，大鼠，雞) ?http://www.informatics.jax.org/
· (專門針對大鼠) ?http://rgd.mcw.edu/
· MGI命名：http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/index.shtml
· 基因的MGI快速指南：
http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/short_gene.shtml
②、 人類/非人類靈長類動物/家畜/ 除了小鼠、大鼠、魚、昆蟲、蒼蠅外默認的其他物種
· 完整的基因名稱不用斜體和希臘字母
例如：insulin-like growth factor 1(胰島素樣生長因子1)
· 基因符號不使用希臘字母和連字符，基因符號用斜體，所有的字母用大寫
例如：IGF1(斜體)
· 蛋白質的名稱與基因符號相同，但不用斜體，并全部大寫
例如：IGF1
· mRNA和cDNA的基因符號和規定的格式
例如："... levels of ?IGF1?(italicized) mRNA increased when..."
更多關于此類物種基因(突變的等位基因)命名規則和符號的網站：
http://www.genenames.org/
③、 魚(適用于所有的魚)
· 完整的基因名稱用斜體表示，全部用小寫字母，不要用希臘字母
例如：cyclops(斜體)
· 基因符號用斜體，全部小寫
例如：cyc(斜體)
· 蛋白質命名與基因符號相同，但僅首字母大寫，也不用斜體
例如：Cyc
更多關于此類物種基因(突變的等位基因)命名規則和符號的網站：
http://zfin.org/cgi-bin/webdriver?MIval=aa-ZDB_home.apg
④、 其他有用的網站：
· ExPASy(特殊蛋白質分析系統)：是瑞士生物信息學研究所(SIB)提供的蛋白質組學服務系統，可對蛋白質序列和結構以及二維PAGE進行分析：(http://au.expasy.org /?)
· OMIM -孟德爾人類遺傳學數據庫：
(www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM?)
· NCBI - Entrez Gene：提供了一個按序列和/或在NCBI's Map Viewer中查詢基因的統一環境。您可以查詢名稱，符號，加入，出版物，GO條款，染色體數目，EC號碼，和許多其他相關基因及它們的編碼產物。 (www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?)
