1、Science:一種細菌性磷脂磷酸酶通過劫持泛素抑制宿主的焦亡
2022年10月14日,來自中國科學院微生物研究所劉翠華等研究人員合作在《科學》雜志發表了標題為“A bacterial phospholipid phosphatase inhibits host pyroptosis by hijacking ubiquitin.”的研究成果,發現一種細菌性磷脂磷酸酶通過劫持泛素抑制宿主的焦亡。
據介紹,炎癥小體介導的GSDMD切割會引起焦亡和炎癥細胞因子的釋放,從而控制病原體感染,但病原體如何逃避這種免疫反應在很大程度上仍未被探索。
研究人員發現,來自結核分枝桿菌的已知蛋白磷酸酶PtpB是一種抑制宿主炎癥小體-焦亡途徑的磷脂磷酸酶。從機制上講,PtpB使宿主細胞膜上的磷脂酰肌醇-4-單磷酸酯和磷脂酰肌醇-(4,5)-雙磷酸酯去磷酸化,從而破壞了切割的gasdermin D(GSDMD)的膜定位,抑制了細胞因子的釋放和巨噬細胞的焦亡。
值得注意的是,這種磷酸酶活性需要PtpB與泛素結合。破壞磷脂磷酸酶活性或PtpB的泛素相互作用模體,可增強宿主GSDMD依賴的免疫反應,并減少細胞內病原體的生存。因此,病原體通過改變宿主的膜組成來抑制焦亡作用并抵消宿主的免疫力。
文章來源:
Qiyao Chai, Shanshan Yu et al ,A bacterial phospholipid phosphatase inhibits host pyroptosis by hijacking ubiquitin.DOI: abq0132. Science:最新IF:41.037
2、Nature:繪制出一個與人類身高相關的常見遺傳變體飽和圖譜
2022年10月12日,來自澳大利亞昆士蘭大學Lo?c Yengo等研究人員合作在期刊《自然》上發表了題為“A saturated map of common genetic variants associated with human height. ”的研究成果,繪制出一個與人類身高相關的常見遺傳變體飽和圖譜。
據預測,常見的SNP共同解釋了人類身高的40-50%的表型變異,但鑒定特定的變體和相關區域需要巨大的樣本量。
研究人員使用來自540萬不同血統個體的全基因組關聯研究的數據,表明與身高顯著相關的12111個獨立單核苷酸多態性(SNP)幾乎占了所有基于SNP的遺傳率。這些SNP聚集在7209個不重疊的基因組片段中,平均大小約為90kb,覆蓋了基因組的21%。獨立關聯的密度在整個基因組中是不同的,密度增加的區域富含生物相關基因。在樣本外估計和預測中,12111個SNP(或HapMap3中的所有SNP)在歐洲血統的人群中占40%(45%)的表型變異,但在其他血統的人群中只占約10-20%(14-24%)。不同血統的效應大小、相關區域和基因優先級相似,表明預測準確性的降低可能是由相關區域內的連鎖不平衡和等位基因頻率的差異造成的。
最后,研究人員表明,相關的生物途徑可以用較小的樣本量檢測出來,而這是牽涉到因果基因和變體所需要的??偟膩碚f,這項研究提供了一個包含絕大多數常見身高相關變體的特定基因組區域的綜合圖譜。雖然這個圖譜在歐洲血統的人群中是飽和的,但要在其他血統中達到同等的飽和度,還需要進一步的研究。
文章來源:
Yengo, Loc, Vedantam, Sailaja et al,? A saturated map of common genetic variants associated with human height. DOI: 10.1038/s41586-022-05275-y, 最新IF:43.07
3、Nature:揭示移植的人類皮層類器官的成熟和回路整合
2022年10月12日,來自美國斯坦福大學教授Sergiu P. Paca及其研究團隊在《自然》雜志上發表了題為“Maturation and circuit integration of transplanted human cortical organoids.”的研究成果,揭示移植的人類皮層類器官的成熟和回路整合。
據介紹,自組織神經類器官是一個很有前途的體外平臺,可以用來模擬人類的發育和疾病。然而,類器官缺乏體內存在的連接性,這限制了其成熟,并使其無法與控制行為的其他回路整合。
研究人員發現,人類干細胞衍生的皮層類器官移植到新生無胸腺大鼠的體感皮層會發展出成熟的細胞類型,并整合到感覺和運動相關的回路。核磁共振顯示移植后的類器官在多個干細胞系和動物中生長,而單核分析則顯示了皮層生成的進展和活動依賴型轉錄程序的出現。事實上,移植的皮層神經元顯示出比體外對應物更復雜的形態、突觸和內在膜特性,這使研究人員能夠發現來自蒂莫西綜合癥患者的神經元的缺陷。
解剖學和功能描記顯示,移植的類器官接受丘腦皮層和皮層的輸入,而體內的神經活動記錄表明,這些輸入可以在人類細胞中產生感覺反應。最后,皮層類器官將軸突延伸到整個大鼠大腦,它們的光遺傳學激活可以驅動尋求獎勵的行為。因此,移植的人類皮層神經元成熟并參與控制行為的宿主回路。研究人員預計,這種方法將有助于檢測患者衍生細胞中的回路級表型,否則無法發現。
文章來源:
Revah, Omer, Gore et al , Maturation and circuit integration of transplanted human cortical organoids.DOI: 10.1038/s41586-022-05277-w,